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采集不同的标本有不同的注意事项，可参照各显微镜检查的详细列示内容。
留取浆膜腔积液的穿刺过程具有创伤性，需严格掌握适应证：需进行诊断或治疗性穿刺；新发生浆膜腔积液；原有的浆膜腔积液突然增多或伴发热。不具备上述适应证者，应尽量避免进行此项检查。 出现以下禁忌证的患者需避免行腰椎穿刺采集脑脊液：穿刺的局部有化脓性感染、处于休克或全身器官衰竭状态、颅内高压、颅后窝占位性病变。
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